“野生与家养绵羊全基因组重测序揭示外型及生产性状相关基因”在国际知名学术期刊《自然通讯》在线发表

原发表日期:2020-06-18来源:科技日报作者:科技日报记者?朱彤?通讯员 陈遂中

原发表日期:2020-06-18

来源:科技日报

作者:科技日报记者?朱彤?通讯员 陈遂中

  6月18日从新疆农垦科学院获悉,近日,新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室与中国农业大学李孟华教授研究团队合作的研究成果“野生与家养绵羊全基因组重测序揭示外型及生产性状相关基因”在国际知名学术杂志《自然通讯》在线发表。该研究成果不仅为绵羊遗传学研究提供了宝贵的基因组资源,也对今后开展分子设计育种、指导家养绵羊遗传改良具有重要指导意义。


  
  专家将鉴定好的胚胎移植给受体羊
  
  绵羊体外胚胎生产


  
  该研究是新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室自2016年1月投入建设运行以来,充分发挥柔性引进高层次人才科研方向的引领作用,在绵羊遗传资源评价与性状遗传机制解析方面所取得的重大研究进展,也是重点实验室与内地高水平科研院所开展合作研究,充分发挥新疆绵羊资源优势和中国科学院动物研究所人才与技术优势所取得的重要成果。
  
  动物驯化是家畜多样性发展的重要起源事件,也是人类文明发展的重要先决条件。绵羊作为最早被驯化的动物之一,经过长期的自然选择与高强度的人工选择,已经形成1400多个表型丰富的现代绵羊品种,是为人类提供肉、毛、皮、奶等产品的重要家畜。利用高深度全基因组重测序数据,鉴定表型性状相关功能变异对指导基因组辅助育种有着重要意义。近期虽有从基因组层面分析绵羊的驯化和育种研究,但都存在样本量较少、测序深度低和表型数据不够充足等局限。
  
  2016年10月,由中国科学院动物研究所研究员(现中国农业大学教授)牵头启动了针对全球特色绵羊品种资源重测序和全基因组关联分析的合作研究项目,项目在省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室兵团专项建设资金、国家自然科学基金杰青项目、面上项目以及中国科学院对外合作项目等多个项目的支持下,在探索绵羊驯化、揭示绵羊尾脂形态等表型及生产性状的遗传机制方面取得重要研究进展。
  
  该研究通过对来自世界各地的包括野羊(亚洲摩弗伦)和家养绵羊在内的43个品种共计284个个体进行高深度全基因组测序,全面深入地揭示了绵羊在驯化、培育改良以及表型性状选择上的遗传机制。


  
  

实验室建设论证会


  
  通过比较近缘野生绵羊和5个古老的家羊品种(来自非洲、中东、欧洲、亚洲)全基因组数据,鉴定出261个可靠的候选基因,并进一步挖掘了36个已在绵羊及其它物种中发现的且具有功能注释的驯化基因(与免疫、繁殖、生长、行为等相关),针对这些基因,发现了6个在野生和家养绵羊间等位基因频率分布差异极显著的非同义突变位点。通过对所有家羊进行基于群体分化指数Fst的绵羊全基因组选择信号检测,筛选了一系列与毛细度、奶产量、窝平均产羔数和尾型等性状相关的候选基因。经实验验证,发现PDGFD基因是影响绵羊尾部脂肪沉积的重要因果基因。(图片均由新疆农垦科学院宣传教育处供图)

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